小麦分子细胞遗传学研究：主要开展小麦遗传和种质创新研究。采用染色体分带和萤光原位杂交相结合的方法，将簇毛麦基因导入栽培小麦，提高小麦的抗病和抗旱能力。抗盐生态学研究：以油葵为主要研究对象，研究不同油葵品种耐盐碱的生理机制，探讨盐碱滩涂逆境与油葵抗氧化及光合作用的相互关系。

研究滩涂生态系统中经济作物对生态系统的影响等。分子生物学研究：以棉花为研究对象，分离和克隆雄性不育和育性恢复基因，探究育性功能基因在棉花杂交育种方面的作用；以高光效棉花为研究对象，研究环境胁迫下不同棉花品种的光合作用效率以及生殖生长与营养生长的关系评价。

Chen Q Z, Qi Z J, Feng Y G, Wang S L, Chen P D. Structural changes of 4V chromosome of Haynaldia villosa induced by gametocidal chromosome 3C of Aegilops triuncialis[J].. Acta Genetica Sinica, 2002, 29 (4): 355-358. (in Chinese) 　　 

Chen Q Z, Wang G F, Chen H F, Chen P D. Development and characterization of Triticum aestivum-Haynaldia villosa translocation line T4VS·4VL-4AL[J]. Acta Agronomic Sinica, 2007 ,33 (6) :871 - 877(in Chinese)

Chen Q Z, Cao A Z, Qi Z J, Zhang W, Chen P D. Structural change of 2V chromosome of Haynaldia villosa induced by gametocidal chromosome 3C of Aegilops triuncialis [J]. Scientia Agricultura Sinica, 2008,41(2): 362-369. (in Chinese)

Chen Q Z, Zhang B J, Zheng Q S. Effects of iso-osmotic salt and water stresses on growth and ionic homeostasis of tomato seedlings. Hubei Agricultural Sciences, 2008,47(5): 255-257. (in Chinese)